黑龍江公別拉河自然保護區位于黑龍江省黑河市西南部,地處黑龍江一級支流公別拉河的上游,距黑河市70km,地理坐標為北緯50°00′46″~50°14′14″,東經126°23′49″~126°50′22″,保護區包括727林場的興安營林區、望江營林區和大平林場的母子溝營林區與冷川營林區等四個營林區的大部分,東西長31.6km,南北寬25.0km,面積為47983hm2。
黑龍江公別拉河自然保護區位于小興安嶺東麓北端,其地形地貌組合為波狀丘陵-河床階地-河谷漫灘或波狀丘陵-山麓平坂組合,成因上,前者以剝蝕洪積為主,后者以剝蝕堆積為主。
黑龍江公別拉河自然保護區位于黑龍江省黑河市的西南部,地處小興安嶺與大興安嶺的接合部,屬寒溫帶濕潤季風氣候區。全年氣候的特點是:冬季漫長,低溫寒冷;春秋短暫,干燥多風;夏季多雨,氣候涼爽;無霜期短,晝夜溫差大;年平均氣溫-1.5℃,極端最高氣溫34.5℃,極端最低氣溫-44.5℃,年平均降水量527.6mm,多集中在6~9月;大風、暴雨、霜凍等災害性天氣比較多。
黑龍江公別拉河自然保護區位于小興安嶺東麓北端,與周邊地區或同緯度地區相比,水資源相對豐富,多年平均降水量550~600mm,主要集中在6~9月。
本區地下水屬小興安嶺東麓低山丘陵水文地質區。其水文地質特征是:基巖裂隙水及第四紀松散物中的潛水都相當發育;地下水主要補給來源以大氣降水為主,由于地形平緩,地下水補給較充足。